MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natronococcus occultus SP4 plasmid 1

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019975	ATA	2	6	853	858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019975	AAC	2	6	953	958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019975	GGCT	2	8	969	976	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019975	AAT	2	6	981	986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019975	GCA	2	6	1038	1043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019975	AG	3	6	1047	1052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019975	TTCG	2	8	1062	1069	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019975	ACG	2	6	1070	1075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019975	CGGT	2	8	1122	1129	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019975	CCG	2	6	1150	1155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_019975	CGTC	2	8	1203	1210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019975	ACCG	2	8	1286	1293	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019975	AAC	2	6	3597	3602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019975	TGGA	2	8	3726	3733	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019975	CGG	2	6	3797	3802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019975	TTG	2	6	4163	4168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019975	GT	3	6	4189	4194	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019975	CAT	2	6	4242	4247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019975	CTG	2	6	4279	4284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019975	ATG	2	6	4318	4323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019975	TA	3	6	4413	4418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019975	TAA	2	6	4431	4436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019975	ACG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019975	TAGA	2	8	4552	4559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019975	TA	3	6	4595	4600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019975	CAA	2	6	4653	4658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019975	TCC	2	6	4671	4676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_019975	CT	3	6	4716	4721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019975	TCC	2	6	4724	4729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_019975	TCAA	2	8	4769	4776	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019975	ATC	2	6	4796	4801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019975	TC	3	6	4830	4835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019975	GTC	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019975	AAC	2	6	4888	4893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019975	AGT	2	6	4925	4930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019975	CTC	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_019975	GAA	2	6	5101	5106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019975	AAG	2	6	5107	5112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019975	TAGT	2	8	5358	5365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019975	ATT	2	6	5376	5381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019975	CCA	2	6	6326	6331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_019975	AACGC	2	10	6348	6357	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_019975	TAA	2	6	6404	6409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019975	GTA	2	6	6428	6433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019975	TGTGA	2	10	7250	7259	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019975	TGG	2	6	7829	7834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019975	GAG	2	6	7853	7858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019975	ACCG	2	8	7906	7913	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019975	GA	3	6	8064	8069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019975	AC	3	6	8088	8093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019975	CAC	2	6	8212	8217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_019975	CCGGAA	2	12	8265	8276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019975	CTA	2	6	8310	8315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019975	GGA	2	6	8373	8378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019975	AAG	2	6	8982	8987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019975	CG	3	6	8994	8999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019975	CAG	2	6	9046	9051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019975	AG	3	6	9066	9071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019975	TC	3	6	9097	9102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019975	AGT	2	6	9174	9179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019975	GGT	2	6	9322	9327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.